20世纪60年代茅台试点采用纸上层析发现茅台窖底香的主体是己酸乙酯，同时它又是浓香型酒的主体香气。20世纪60年代开始，中科院西南生物研究所、四川省食品研究所、四川大学、山东大学、天津科技大学、江南大学、内蒙古轻工所、广西轻工所、黑龙江轻工所以及许多名优酒厂都先后对浓香型酒酿造的窖池、窖泥、窖内外微生物做了不同深度的研究，取得了可喜的成果。
（一）窖泥微生物的研究逐步深入
1．老窖菌群结构与生态分布及功能菌的选育
中科院成都生物所与泸州曲酒厂、五粮液酒厂自20世纪60年代起对浓香型名酒发酵微生物、发酵机理进行了长期的研究。在老窖的菌群结构与生态分布、泸型酒生香功能菌的发酵、老窖的己酸与甲烷菌的相互关系等方面，取得了许多宝贵的资料，找出了新、老窖泥的差异及酒质不同的原因，并将许多重要成果应用于生产。20世纪70年代内蒙古轻工所曾搜集了国内一些名优白酒厂的窖泥，从中分离出己酸菌（内蒙古30#），应用于液态白酒及浓香型酒生产，取得了明显效果。辽宁大学生物系分离的梭状芽孢杆菌（己酸菌）应用于生产。1979年从沈阳老龙口酒厂窖泥中筛选出己酸菌L-Ⅱ号菌种，产己酸稳定在120~150mg/lOOmL。
在窖泥功能菌与产酯菌共酵生产应用方面，1986年四川省食品发酵工业研究设计院与泸州曲酒厂合作，通过半年连续三排试验，酒质可提高1~2个等级。
2．窖泥微生物群落的研究及其应用
四川大学、泸州老窖胡承、应鸿等在2004年的研究中认为，窖泥微生态系统是由厌氧异养菌、甲烷菌、己酸菌、乳酸菌、硫酸盐还原菌和硝酸盐还原菌等多种微生物组成的微生物共生群落系统。在该微生物群落中随窖池层次分布顺序的不同和窖泥化学生态的不同，菌类菌种呈现明显区别。浓香型白酒的固态发酵过程就是一个典型的微生物群落的演替过程和各菌种间的共生、共酵、代谢调控过程。该项过程不但对微生态群落中的菌种演 替具有反馈抑制作用，而且直接影响白酒的产量和质量。研究和应用微生物生态学理论，对人工窖泥培养和提高酒质具有指导意义。
3、利用乳球菌延缓窖池老化
由于受气候、环境及生产原料、生产工艺的制约，人工老窖在应用一段时间后，窖泥中微生物失活、老化、死亡现象严重，同时由于酒醅在发酵过程中产生大量乳酸及其酯关，经长时间聚集，容易生成乳酸钙，使窖泥中功能菌减少，造成窖泥板结、老化，有白色乳酸钙析出，并且造成有益功能菌难以进入酒醅。为延缓窖泥老化及减轻老化程度，许多厂应用添加活性窖泥功能菌液、强化窖池保养等措施，以延缓窖池老化，但在北方不少厂成效并不理想。江苏洋河酒厂陈翔、王亚庆从窖泥中分离出1株最新菌株L-乳球菌，经近5年的潜心试验，证明L-乳球菌能利用酒醅中的乳酸，抑制乳酸乙酯的生成，同时提高其他酸与乙醇的酯化作用，促进其他酯类的生成。另外，将L-乳球菌加到人工老窖泥中，使酒醅发酵产生的乳酸不致渗入窖壁，抑制乳酸钙的生成，使窖池老化程度延缓5年以上。L-乳球菌属细菌类，为混合菌株，来自窖泥，无芽孢，适宜在厌氧环境中生长，最适生长温度为30~32℃，pH为4.5~5.0，其代谢产物为琥珀酸和丙酸。将培养好的L一乳酸菌液与己酸菌液按相应比例加入人工老窖池中，可减少乳酸和乳酸钙的生成，从而延缓窖泥老化时间。使用L-乳球菌液养窖的窖池，优质酒率可增加4%～19%，己酸乙酯高lOOmg/lOOmL，乳酸乙酯下降40~80mg/lOOmL。
4．窖泥中乳酸菌的分离鉴定
浓香型白酒生产的原酒中，普遍存在乳酸乙酯偏高的现象。乳酸及其酯类偏高，原因较多，但曲药和窖泥是其关键。以前，对窖泥中的乳酸菌研究较少。2005年黑龙江大学生命科学院王葳、赵辉等对浓香型白酒窖泥中的乳酸菌进行了分离和鉴定，得到3株不同的乳酸菌，分别是玉米乳酸菌、戊糖乳酸菌、乳酸片球菌，并对这3株乳酸菌的产酸特性进行了分析，得到最佳产酸条件：最适温度37℃，最适时间为72h，最适pH5.0。窖泥中乳酸菌的研究，为人工培窖如何减少和抑制乳酸菌的数量并控制其生长繁殖提供了参考依据。
（二）人工培窖配方的研究
自20世纪60年代百年老窖成分的揭秘和窖泥微生物研究的不断深入，人工培窖配方全国各地进行了广泛的研究，百花齐放，各有高招。培养窖泥原料的选择总的原则是根窖泥微生物生长发育所需进行配伍，要因地制宜合理选择和搭配。
（三）窖泥成分和窖泥老化的研究
20世纪80年代中科院成都生物所对窖泥中的氨基酸、无机物及微量元素和白色团块及白色结晶物等进行了系统的研究，发现百年老窖泥中氨基酸含量比土壤中高数倍至数倍，其氨基酸含量随窖池上、中、下层的次序增加。百年老窖比一般曲酒窖和人工老窖无机及微量元素要高，特别是锌、锰、钙、镁、钼、钛等；一般人工培窖中有效磷偏高，为百老窖的2.7~9.8倍，值得注意。窖泥中白色团块和白色晶体会使己酸菌和窖泥混合菌产酸下降，会使已酸和丁酸比例失调。
20世纪80年代以来，许多酒厂为防止窖泥老化与科研单位、大专院校共同研究，在理论上和实践上都取得了丰硕成果，主张采用黄浆水、液体窖泥并适当补加N、P、K等微量元素来养护窖泥，可有效防治窖泥老化。