一、嘴巴不同
土鲶鱼和大口鲶的嘴巴不同，其中土鲶鱼的口下位，口裂小，末端仅达眼前缘下方；大口鲶的嘴巴大，口裂末端可达或超过眼中部下方。
二、体色不同
土鲶鱼和大口鲶的体色不同，其中土鲶鱼的体色通常呈黑褐色或灰黑色，略有暗云状斑块；大口鲶的体色呈暗灰色，身上一般没有斑点。
三、体型不同
土鲶鱼和大口鲶的体型不同，其中土鲶鱼个体小，常见个体1～2斤，最大个体可达5～6斤；大口鲶常见个体2～5千克，最大可达50千克。
四、习性不同
土鲶鱼和大口鲶的习性不同，其中土鲶鱼多在沿岸地带活动，秋后在深水污泥中越冬；大口鲶是典型的底栖性鱼类，不善跳跃，不钻泥。
五、分布不同
土鲶鱼和大口鲶的分布不同，其中土鲶鱼的布广泛，全国各地普遍都有分布；大口鲶分布在南方地区，尤以长江流域和珠江流域最常见。