引起对虾鳃病的原因不止一种，弧菌、原生动物、丝状细菌感染会引起对虾鳃病，水质不良、营养不良等也可能引起对虾鳃病。
对虾，学名东方对虾，又称中国对虾、斑节虾、中国明对虾，属于节肢动物门，软甲纲，十足目，对虾科，对虾属。
对虾烂鳃病的病因：
1、不良水质，如：重金属、氨氮、亚硝酸盐等有毒物质高；
2、养殖水体pH值变化大：pH值持续低于6.5或高于9.2；
3、细菌感染：病原是弧菌、气单胞杆菌；
4、纤毛虫感染：由固着类聚缩虫、单缩虫和累枝虫、钟形虫附着在腮丝。
5、有机质，藻类附生：养殖水体裸甲藻，蓝藻爆发，藻类老化有机颗粒较多或持续高温闷热，暴雨天气过后水体出现温差大造成泛底，藻类倒藻，鳃部沾了底泥，死藻堵塞对虾鳃部，加上溶解氧低造成虾鳃功能性损伤，均会导致对虾发生肿鳃、绿鳃、烂鳃、黄鳃、黑鳃等鳃部问题。