中华鲟的饲料种类很多，幼鲟与成年中华鲟的饲料不同，中华鲟是一种以动物性食物为主的偏肉食性鱼类。
幼鲟吃的饲料主要有水生寡毛类、枝角类、水生昆虫幼虫类等食物，包括颤蚓、尾鳃蚓及水丝蚓，隆线溞及蚤状溞，摇蚊幼虫和虾类等。而成年中华鲟主要喂食各种饲料鱼块，主要有鲫鱼、草鱼、鲢鱼和罗非鱼等。
在天然水域中，幼鱼期主要摄食底栖无脊椎动物，主要为水蚤类，也可摄食小型虾、蟹、蚬类；成鲟在海洋中主要摄食底栖鱼类。在生殖洄游期间，亲鲟一般停食。
人工养殖的条件下，不同生长阶段的中华鲟摄食的饲料种类不同：
1、中华鲟仔鱼在全长3.05±0.07厘米时开始摄食，主要摄食水生寡毛类、摇蚊幼虫、枝角类和桡足类；
2、幼鲟以水生寡毛类(水丝蚓、颤蚓、尾鳃蚓等)，枝角类(蚤状溞、隆线溞等)，水生昆虫幼虫(摇蚊幼虫)和虾类等为主食；
3、成鲟则主要摄食各种饲料鱼块(如鲫鱼、罗非鱼、鲢鱼和草鱼等)。