一、体型
野生泥鳅和养殖泥鳅的体型不同，其中野生泥鳅生活在自然水体中，食物来源少，活动量大，体型瘦小，一般都在5厘米以内；养殖泥鳅生活在养殖池塘中，食物充足，活动量小，体型肥壮，一般都在5厘米以上。
二、品种
野生泥鳅和养殖泥鳅的品种不同，其中野生泥鳅一般都是本地泥鳅，品种也可能不止一种，往往十几条中就可能出现好几个品种；养殖泥鳅一般都是人工改良成的，品种统一，几十条中也很难能看到不同的品种。
三、颜色
野生泥鳅和养殖泥鳅的颜色不同，其中野生泥鳅生活在环境复杂的自然水体中，为了躲避天敌往往会进化出各种各样的伪装色；养殖泥鳅生活在环境简单的养殖池塘中，鲜有敌害的威胁，体表颜色往往比较统一。
四、活性
野生泥鳅和养殖泥鳅的活性不同，其中野生泥鳅的活性比较强，放到水盆中往往会来回的翻动，尤其是抓的时候会非常灵活；养殖泥鳅的活性比较差，放到水盆中会显得很安静，抓的时候也比野生泥鳅好抓得多。
五、规格
野生泥鳅和养殖泥鳅的规格不同，其中野生泥鳅的规格参差不齐，小的可能不足2厘米，大的可能有4～5厘米；养殖泥鳅的规格非常统一，即使有区别也不明显，毕竟都是同一批种苗在同样的池塘和管理下长大的。