在对鱼塘水质进行净化时，可以用东方复合碘、益生菌液等药物。新建的池塘或老塘彻底清塘之后，在放苗前15天左右进行水质净化。
鱼塘水质净化的方法参考如下：
1、东方复合碘兑水稀释后，全池均匀泼洒，每瓶可以供8-10亩的池塘使用。
2、益生菌液、生石灰兑水后，全池泼洒，也可以起到净化水质的作用。
每年冬季和早春季节水温较低，池水处在相对静态，水质清澈，此时水质调控方法是清塘消毒，施基肥，为鱼类饲养打好水质基础。
不同季节水质净化的常用方法：
春季到夏初（3～6月）季节，水温不断回升；秋季到冬初（9～11月）季节，水温又不断下降。在这两个时期，尤其是处于交叉阶段时，经常注入新水，并对症药物预防鱼病，调控水质。根据主养鱼类不同，进行适当追肥、投饵，可以形成良好的水色和水质。
在夏季7～8月间，水温升高，需人工调控水质：①当需要施肥时停止使用有机肥，巧施化肥；②经常注入新水，并且要搅动上下水层；③用好增氧机搅动水层，在剧烈天气变化之前和之后进行池塘增氧，防止鱼类出现严重浮头和泛塘现象。