一、物种论述
红虫和蚯蚓的物种定义不同，其中红虫是摇蚊的幼虫，在生物学分类上属于动物界、节肢动物门、昆虫纲、双翅目、摇蚊科水生昆虫的统称；而蚯蚓则是动物界、环节动物门、寡毛纲陆栖无脊椎动物的统称。
二、形态特征
红虫和蚯蚓的外观形态不同，其中红虫呈蠕虫状，由头壳和12个体节组成，各体节粗细相近、外形相似，体色从白色至鲜红色、血红色；而蚯蚓则呈圆柱形，由100多个体节组成，第11节后每节有背孔，没有骨骼，体表覆盖一层具有色素的薄角质层，除前两节外其余各节均有刚毛。
三、摄食习性
红虫和蚯蚓的摄食习性不同，其中红虫可分肉食性和杂食性两大类，肉食性种类以甲壳类、寡毛类、其他红虫等为食，杂食性种类以细菌、藻类、浮游动物等为食；而蚯蚓则是典型的腐食性动物，以土壤中的有机物为食，靠吞食土壤以获取其中的有机物。
四、栖息环境
红虫和蚯蚓的栖息环境不同，其中红虫是水生动物，可生活在各种水体中，其生物量可占到水体底栖动物总量的50～90%；而蚯蚓则是陆生动物，喜栖息在阴暗潮湿、土质疏松且富含腐殖质的泥土中，喜暗畏光，喜温畏寒，喜湿怕干，喜静畏动，喜酸怕盐。
五、生态作用
红虫和蚯蚓的生态作用不同，其中红虫不但是水生食物链网最重要的环节，还有加速物质循环、消除有机物污染等作用；而蚯蚓在土壤改良、消除公害、保护生态环境等方面和土壤物质循环、生物多样性等方面都发挥着不可替代的作用。